DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Gallus gallus'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1DTL_A_BEPA204 1dtl BEP

DB01244
(Bepridil) 		Gallus gallus CARDIAC TROPONIN C PF13499
(EF-hand_7)
PF13833
(EF-hand_8) 		11 PHE A  27
ILE A  36
LEU A  41
MET A  45
LEU A  48
MET A  60
VAL A  64
MET A  80
GLU A  96
LEU A  97
LEU A 100
 BEP A 204
1DTL_A_BEPA205 1dtl BEP

DB01244
(Bepridil) 		Gallus gallus CARDIAC TROPONIN C PF13499
(EF-hand_7)
PF13833
(EF-hand_8) 		12 ALA A  23
ILE A  26
PHE A  27
PHE A  77
MET A  81
LEU A 100
PHE A 104
LEU A 117
MET A 120
LEU A 136
PHE A 156
MET A 157
 BEP A 205
1DTL_A_BEPA206 1dtl BEP

DB01244
(Bepridil) 		Gallus gallus CARDIAC TROPONIN C PF13499
(EF-hand_7)
PF13833
(EF-hand_8) 		8 MET A  45
GLN A  50
PRO A  52
GLU A  56
GLU A  96
ASP A  99
ARG A 102
MET A 103
 BEP A 206
1IIU_A_RTLA176 1iiu RTL

DB00162
(Vitamin
A) 		Gallus gallus PLASMA
RETINOL-BINDING
PROTEIN 		PF00061
(Lipocalin) 		11 LEU A  35
LEU A  37
ALA A  55
ALA A  57
MET A  73
MET A  88
TYR A  90
LEU A  97
GLN A  98
HIS A 104
ARG A 121
 RTL A 176
1N4F_A_ASRA140 1n4f ASR

DB03006
(Arsanilic
acid) 		Gallus gallus LYSOZYME C PF00062
(Lys) 		3 ASN A  37
ALA A  42
ASN A  44
 ASR A 140
1N4F_A_ASRA141 1n4f ASR

DB03006
(Arsanilic
acid) 		Gallus gallus LYSOZYME C PF00062
(Lys) 		6 ASN A  65
ASP A  66
GLY A  67
THR A  69
PRO A  70
SER A  72
 ASR A 141
1RLB_E_REAE176 1rlb REA

DB00755
(Tretinoin) 		Gallus gallus RETINOL BINDING
PROTEIN 		PF00061
(Lipocalin) 		10 LEU E  37
ALA E  55
ALA E  57
VAL E  61
MET E  73
LEU E  97
GLN E  98
ASP E 102
GLN E 117
PHE E 135
 REA E 176
1RLB_F_REAF177 1rlb REA

DB00755
(Tretinoin) 		Gallus gallus RETINOL BINDING
PROTEIN 		no annotation 11 PHE F  36
LEU F  37
ALA F  55
ALA F  57
VAL F  61
LEU F  63
MET F  73
MET F  88
TYR F  90
LEU F  97
GLN F  98
 REA F 177
1TW4_A_CHDA130 1tw4 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Gallus gallus FATTY ACID-BINDING
PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		15 TYR A  14
LEU A  18
LEU A  21
LEU A  27
ALA A  31
ILE A  34
THR A  53
ARG A  55
GLN A  56
MET A  73
ASP A  74
HIS A  98
ILE A 111
LEU A 118
ARG A 120
 CHD A 130
1TW4_A_CHDA131 1tw4 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Gallus gallus FATTY ACID-BINDING
PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		11 LEU A  21
ASN A  60
ILE A  70
THR A  72
LYS A  76
LEU A  78
VAL A  82
THR A  91
PHE A  96
HIS A  98
GLN A 100
 CHD A 131
1TW4_B_CHDB1130 1tw4 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Gallus gallus FATTY ACID-BINDING
PROTEIN 		None 13 TYR B  14
LEU B  18
LEU B  21
LEU B  27
ILE B  34
THR B  53
ARG B  55
GLN B  56
MET B  73
HIS B  98
ILE B 111
LEU B 118
ARG B 120
 CHD B1130
1TW4_B_CHDB1131 1tw4 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Gallus gallus FATTY ACID-BINDING
PROTEIN 		None 10 LEU B  21
ASN B  60
ILE B  70
THR B  72
LYS B  76
VAL B  82
THR B  91
PHE B  96
HIS B  98
GLN B 100
 CHD B1131
1YRI_A_ACTA502 1yri ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Gallus gallus VILLIN PF02209
(VHP) 		4 LEU A  42
ARG A  55
LYS A  70
LEU A  75
 ACT A 502
2JN3_A_JN3A130 2jn3 JN3

DB01586
(Ursodeoxycholic
acid) 		Gallus gallus FATTY ACID-BINDING
PROTEIN, LIVER 		PF14651
(Lipocalin_7) 		19 TYR A  14
PHE A  17
LEU A  18
LEU A  21
LEU A  23
LEU A  27
ALA A  31
ILE A  34
PRO A  36
THR A  53
ARG A  55
GLN A  56
MET A  73
ASP A  74
HIS A  98
GLU A 109
ILE A 111
LEU A 118
ARG A 120
 JN3 A 130
2JN3_A_JN3A131 2jn3 JN3

DB01586
(Ursodeoxycholic
acid) 		Gallus gallus FATTY ACID-BINDING
PROTEIN, LIVER 		PF14651
(Lipocalin_7) 		18 LEU A  21
VAL A  49
ASN A  60
PHE A  62
ILE A  70
THR A  72
LYS A  76
LEU A  78
CYS A  80
VAL A  82
LEU A  89
THR A  91
LYS A  95
PHE A  96
HIS A  98
GLN A 100
ILE A 111
PHE A 113
 JN3 A 131
2OIQ_A_STIA1001 2oiq STI

DB00619
(Imatinib) 		Gallus gallus PROTO-ONCOGENE
TYROSINE-PROTEIN
KINASE SRC 		PF07714
(Pkinase_Tyr) 		17 LEU A 273
VAL A 281
ALA A 293
LYS A 295
GLU A 310
VAL A 313
MET A 314
LEU A 317
ILE A 336
THR A 338
TYR A 340
MET A 341
GLY A 344
ARG A 385
LEU A 393
ALA A 403
ASP A 404
 STI A1001
3G5D_A_1N1A1 3g5d 1N1

DB01254
(Dasatinib) 		Gallus gallus PROTO-ONCOGENE
TYROSINE-PROTEIN
KINASE SRC 		PF07714
(Pkinase_Tyr) 		14 LEU A 273
VAL A 281
ALA A 293
LYS A 295
GLU A 310
MET A 314
VAL A 323
ILE A 336
THR A 338
TYR A 340
MET A 341
GLY A 344
LEU A 393
ALA A 403
 1N1 A   1
3G5D_B_1N1B1 3g5d 1N1

DB01254
(Dasatinib) 		Gallus gallus PROTO-ONCOGENE
TYROSINE-PROTEIN
KINASE SRC 		no annotation 14 LEU B 273
VAL B 281
ALA B 293
LYS B 295
GLU B 310
MET B 314
VAL B 323
ILE B 336
THR B 338
TYR B 340
MET B 341
GLY B 344
LEU B 393
ALA B 403
 1N1 B   1
3OEZ_A_STIA601 3oez STI

DB00619
(Imatinib) 		Gallus gallus PROTO-ONCOGENE
TYROSINE-PROTEIN
KINASE SRC 		PF07714
(Pkinase_Tyr) 		17 VAL A 281
ALA A 293
LYS A 295
GLU A 310
VAL A 313
MET A 314
ILE A 317
VAL A 323
ILE A 336
THR A 338
TYR A 340
MET A 341
GLY A 344
ARG A 385
LEU A 393
ALA A 403
ASP A 404
 STI A 601
3OEZ_B_STIB601 3oez STI

DB00619
(Imatinib) 		Gallus gallus PROTO-ONCOGENE
TYROSINE-PROTEIN
KINASE SRC 		no annotation 14 VAL B 281
ALA B 293
LYS B 295
GLU B 310
VAL B 313
MET B 314
ILE B 336
THR B 338
TYR B 340
MET B 341
ARG B 385
LEU B 393
ALA B 403
ASP B 404
 STI B 601
3P73_A_ACTA275 3p73 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Gallus gallus MHC RFP-Y CLASS I
ALPHA CHAIN 		PF00129
(C1-set)
PF07654
(MHC_I) 		3 ILE A 106
VAL A 162
ARG A 166
 ACT A 275
3P73_A_ACTA276 3p73 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Gallus gallus MHC RFP-Y CLASS I
ALPHA CHAIN 		PF00129
(C1-set)
PF07654
(MHC_I) 		5 TRP A  74
ARG A  82
THR A 139
ARG A 142
TRP A 143
 ACT A 276
3QLG_A_1N1A601 3qlg 1N1

DB01254
(Dasatinib) 		Gallus gallus PROTO-ONCOGENE
TYROSINE-PROTEIN
KINASE SRC 		PF07714
(Pkinase_Tyr) 		14 LEU A 273
VAL A 281
ALA A 293
LYS A 295
GLU A 310
MET A 314
VAL A 323
ILE A 336
THR A 338
TYR A 340
MET A 341
GLY A 344
LEU A 393
ALA A 403
 1N1 A 601
3QLG_B_1N1B601 3qlg 1N1

DB01254
(Dasatinib) 		Gallus gallus PROTO-ONCOGENE
TYROSINE-PROTEIN
KINASE SRC 		no annotation 16 LEU B 273
VAL B 281
ALA B 293
LYS B 295
GLU B 310
MET B 314
VAL B 323
ILE B 336
THR B 338
TYR B 340
MET B 341
LYS B 343
GLY B 344
LEU B 393
ALA B 403
ASP B 404
 1N1 B 601
3UVV_A_T3A501 3uvv T3

DB00279
(Liothyronine) 		Gallus gallus THYROID HORMONE
RECEPTOR ALPHA 		PF00104
(Hormone_recep) 		15 ILE A 219
ILE A 220
ALA A 223
ARG A 226
MET A 254
MET A 257
ARG A 260
ALA A 261
LEU A 274
LEU A 285
LEU A 290
ILE A 297
HIS A 379
MET A 386
PHE A 399
  T3 A 501
4AGA_A_ACTA1131 4aga ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Gallus gallus LYSOZYME C PF00062
(Lys) 		3 ASN A  46
ASP A  52
ASN A  59
 ACT A1131
4BCS_A_ACTA1126 4bcs ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Gallus gallus CHIMERIC AVIDIN PF01382
(Avidin) 		4 THR A  11
GLN A 121
ARG A 122
THR A 123
 ACT A1126
4CI1_B_EF2B1429 4ci1 EF2

DB01041
(Thalidomide) 		Gallus gallus PROTEIN CEREBLON PF02190
(LON_substr_bdg)
PF03226
(Yippee-Mis18) 		10 ASN B 353
PRO B 354
HIS B 355
HIS B 359
HIS B 380
SER B 381
TRP B 382
TRP B 388
TRP B 402
PHE B 404
 EF2 B1429
4CI2_B_LVYB1429 4ci2 LVY

DB00480
(Lenalidomide) 		Gallus gallus PROTEIN CEREBLON PF02190
(LON_substr_bdg)
PF03226
(Yippee-Mis18) 		9 ASN B 353
PRO B 354
HIS B 355
HIS B 380
SER B 381
TRP B 382
TRP B 388
TRP B 402
PHE B 404
 LVY B1429
4CI3_B_Y70B1429 4ci3 Y70

DB08910
(Pomalidomide) 		Gallus gallus PROTEIN CEREBLON PF02190
(LON_substr_bdg)
PF03226
(Yippee-Mis18) 		10 ASN B 353
PRO B 354
HIS B 355
HIS B 359
HIS B 380
SER B 381
TRP B 382
TRP B 388
TRP B 402
PHE B 404
 Y70 B1429
4II8_A_010A210 4ii8 010

DB06770
(Benzyl
alcohol) 		Gallus gallus LYSOZYME C PF00062
(Lys) 		7 GLU A  35
ASP A  52
GLN A  57
ASN A  59
TRP A  63
ILE A  98
TRP A 108
 010 A 210
4NTX_A_AMRA509 4ntx AMR

DB00594
(Amiloride) 		Gallus gallus;
Micrurus tener 		ACID-SENSING ION
CHANNEL 1;
BASIC PHOSPHOLIPASE
A2 HOMOLOG TX-BETA 		PF00068
(Phospholip_A2_1)
PF00858
(ASC) 		6 ASN C  83
ARG C  87
GLU A 236
ASP A 238
ASP A 350
GLU A 354
 AMR A 509
4U5J_A_RXTA601 4u5j RXT

DB08877
(Ruxolitinib) 		Gallus gallus PROTO-ONCOGENE
TYROSINE-PROTEIN
KINASE SRC 		PF07714
(Pkinase_Tyr) 		11 LEU A 273
GLY A 276
VAL A 281
ALA A 293
TYR A 340
MET A 341
GLY A 344
ASN A 391
LEU A 393
ALA A 403
ASP A 404
 RXT A 601
4U5J_B_RXTB601 4u5j RXT

DB08877
(Ruxolitinib) 		Gallus gallus PROTO-ONCOGENE
TYROSINE-PROTEIN
KINASE SRC 		no annotation 9 LEU B 273
VAL B 281
ALA B 293
LYS B 295
TYR B 340
MET B 341
GLY B 344
LEU B 393
ASP B 404
 RXT B 601
5DL9_A_ACTA214 5dl9 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Gallus gallus LYSOZYME C PF00062
(Lys) 		5 GLU A  35
ASP A  52
TRP A 108
VAL A 109
ALA A 110
 ACT A 214
5I1N_F_DVAF9 5i1n DVA

DB00161
(L-
Valine) 		Gallus gallus;
synthetic
construct 		D-VILLIN HEADPIECE
SUBDOMAIN;
VILLIN-1 		None 3 ALA C  16
ASN C  19
LEU C  20
 DVA F   9
5I1N_G_DVAG9 5i1n DVA

DB00161
(L-
Valine) 		Gallus gallus;
synthetic
construct 		D-VILLIN HEADPIECE
SUBDOMAIN;
VILLIN-1 		None 3 ALA B  16
ASN B  19
LEU B  20
 DVA G   9
5I1O_F_DVAF9 5i1o DVA

DB00161
(L-
Valine) 		Gallus gallus;
synthetic
construct 		D-VILLIN HEADPIECE
SUBDOMAIN;
VILLIN-1 		None 3 ALA C  16
ASN C  19
LEU C  20
 DVA F   9
5I1O_H_DVAH9 5i1o DVA

DB00161
(L-
Valine) 		Gallus gallus;
synthetic
construct 		D-VILLIN HEADPIECE
SUBDOMAIN;
VILLIN-1 		None
PF02209
(VHP) 		3 ALA A  16
ASN A  19
LEU A  20
 DVA H   9
5I1P_F_DVAF9 5i1p DVA

DB00161
(L-
Valine) 		Gallus gallus;
synthetic
construct 		D-VILLIN HEADPIECE
SUBDOMAIN;
VILLIN-1 		None
PF02209
(VHP) 		3 ALA A  16
ASN A  19
LEU A  20
 DVA F   9
5I1P_G_DVAG9 5i1p DVA

DB00161
(L-
Valine) 		Gallus gallus;
synthetic
construct 		D-VILLIN HEADPIECE
SUBDOMAIN;
VILLIN-1 		None 3 ALA D  16
ASN D  19
LEU D  20
 DVA G   9
5LUR_A_STRA201 5lur STR

DB00396
(Progesterone) 		Gallus gallus AVIDIN PF01382
(Avidin) 		10 MET A  14
HIS A  16
TYR A  33
VAL A  37
TRP A  70
PHE A  72
THR A  77
PHE A  79
TRP A  97
ASN A 118
 STR A 201
5LUR_B_STRB201 5lur STR

DB00396
(Progesterone) 		Gallus gallus AVIDIN no annotation 11 MET B  14
HIS B  16
TYR B  33
ALA B  35
VAL B  37
TRP B  70
PHE B  72
THR B  77
PHE B  79
TRP B  97
ASN B 118
 STR B 201